Laboratorijos uždaviniai:

• Kokybiškai ir tiksliai atlikti pristatytų į Laboratoriją naftos produktų bandymus.
• Užtikrinti bandymų rezultatų objektyvumą, pilnumą, tikslumą, patikimumą, bandymų rezultatų konfidencialumą bei nešališkumą užsakovo atžvilgiu.
• Atliekant bandymus griežtai vadovautis Lietuvos, Europos ir tarptautiniais standartais, kitais teisės aktais, nustatančiais reikalavimus bandomiesiems objektams ir jų bandymų metodams. 

Laboratorija, įgyvendindama jai pavestus uždavinius, vykdo šias funkcijas:

• Atlieka naftos produktų kokybės rodiklių vertinimą vadovaujantis Lietuvos Respublikos energetikos ministro, Lietuvos Respublikos aplinkos ministro, Lietuvos Respublikos susisiekimo ministro įsakymu Nr. 1-348/D1-1014/3-742 “Dėl Lietuvos Respublikoje vartojamų naftos produktų, biodegalų ir skystojo kuro privalomųjų kokybės rodiklių patvirtinimo“.
• Vykdo sieros kiekio kontrolę jūriniame kure vadovaujantis Tarptautine konvencija dėl teršimo iš laivų prevencijos 73/78 (MARPOL).
• Tikrina valstybės rezerve esančio kuro kokybę vadovaujantis Lietuvos Respublikos naftos produktų ir naftos valstybės atsargų įstatymu Nr. IX-986.
• Pagal kompetenciją koordinuoja veiklą, rengiant kokybės užtikrinimo priemonių planus bei dalyvaujant palyginamuosiuose tyrimuose, planuojant naujos įrangos įsigijimą ir esamos įrangos tinkamos būklės užtikrinimą.
• Pagal kompetenciją įgyvendina kokybės vadybos sistemą ir savo veikloje ja vadovaujasi.
• Užtikrina akredituotos veiklos atitiktį standartų ir kitiems reikalavimams.
• Vykdo kitas įstatymų ir kitų teisės aktų nustatytas funkcijas.